初心者のくせにすみません。
でも、公式にも載ってないし、
ググっても出てこないので
自力でここまで辿り着ける人って
そんなにいないと思うんです。
という訳で、
1:「魔法のシャベル」を装備する
まずは、これが無いとはじまらないからね。
普通の「シャベル」じゃダメ。
逆に、「シャベル」で採集できるところで
「魔法のシャベル」では掘り掘りできません。
下位互換はしてないのね、残念。
2:ターゲット(目標)を見つける
村の所々にある白い花「魔力の花」とか
村を出た西海岸にいっぱいある「ヒトデ」とか。

3:目標をセンターに入れて右クリック(ぇ
じゃなくて、目標にカーソルを合わせると
マウスカーソルがシャベル型になるので
「右クリック」する事
<はい、ここ重要!
スキルの「採集」で左クリックしても
永遠に採れませんのでご注意を。
4:掘りのモーションに入ればしばし待つ(約30秒)
初級採集とか釣りとかと一緒ね。
5:コマンドを入力せよ!
「↑↑↓↓←スペースっ!」みたいな。
これも初級採集でやってるから平気ですよね?

で、中級採集ができるのだが
ちょっとだけコツがある。
遠距離から右クリックしても
近くまでは移動してくれるんだけど
「モーションに入らない」事がある。
なので、至近距離で右クリックしてやるといい。
目安として、クイックスロットに「採集」を入れておくと
モーションに入ると赤丸のように「採集」が暗転します。

後は、獲得アイテムについて。
「魔力の花」からは
・魔力の花
・木材
・魔力を失った箱
・ハウスボックス
など
「ヒトデ」からは
・ヒトデ(各種。10種類あります)
・魔力の花
など
だと思われます。
抜けてたらすみません。
参考程度に。
こんな感じかな?